报告人：中国科技大学徐云博士
题目：生物序列分析的高性能算法研究
时间：2011.4.14下午13:30
地点：201
报告摘要：
DNA、蛋白质以及生物文献是生物学领域中的基本数据序列，这些数据在最近的十几年里有了爆炸性的增长，迫切需要高性能的计算方法和算法。从计算机科学的角度出发，可将其分为面向DNA和蛋白质序列分析的小字符集问题和面向生物文献中的文本序列分析的大字符集问题。对于小字符集问题，我们开展了非均衡分块方法、动态规划矩阵并行化等方面的研究；对于大字符集问题，我们开展了生物实体名和蛋白质相互作用关系的数据挖掘研究。
报告人介绍：
徐云博士，现任中国科学技术大学计算机学院副教授、安徽省高性能计算及其应用重点实验室副主任。主要研究方向为高性能生物信息计算以及并行计算模型和性能优化。主持国家自然科学基金面上项目和863重大专项子课题各1项，主要参加国家重点自然科学基金课题、973子课题、“核高基”专项子课题多项。在Bioinformatics、BMC Bioinformatics、计算机学报和软件学报等刊物和国际学术会议上发表学术论文50余篇。
